Wie bei allen anderen Körpertherapien kann auch die Osteopathie nicht immer eingesetzt werden.

So gibt es einige Situationen, bei denen die Osteopathie nicht angewendet wird. Diese liegen u.a. in der Notfallmedizin und der akuten Schädigung von Strukturen (Knochenbrüche, akute Verletzungen und Entzündungsprozesse). Auch akute seelische Störungen fallen nicht ins Tätigkeitsfeld der Osteopathie. Es ist sinnvoll, in solchen Fällen zuerst die Diagnostik und Behandlung der Schulmedizin, bzw. der Trauma- oder Psychotherapie in Anspruch zu nehmen, bevor eine osteopathische Behandlung erfolgen kann.